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抗擊新冠病毒:NVIDIA免費開放GPU基因組測序軟件

2020-3-22 21:49| 發布者: | 查看: 7422| 評論: 17|來自:

摘要: 為應對新冠病毒疫情,NVIDIA宣布,將向全球所有COVID-19新型冠狀病毒研究人員免費提供90天的Parabricks軟件使用權。

為應對新冠病毒疫情,NVIDIA宣布,將向全球所有COVID-19新型冠狀病毒研究人員免費提供90天的Parabricks軟件使用權。

NVIDIA Parabricks軟件基于著名的Genome Analysis Toolkit工具包,可通過GPU加速計算,將序列數據分析的速度提高50倍。

目前,各地科研人員正在對新狀病毒和COVID-19感染者的基因組進行測序,以了解疾病的傳播方式并確定易感染人群,但分析基因組序列需要耗費大量的時間和計算力。

Parabricks團隊去年12月剛剛加入NVIDIA,他們的軟件可以在一臺服務器上快速分析一個人的全部基因組變異,并且將分析時間從傳統的幾天,縮短至一個小時以內。

鑒于此次疫情史無前例的傳播速度,如此巨大的提速無疑將對了解病毒進化、疫苗開發帶來巨大的推動作用。

NVIDIA也在聯系云服務供應商和超級計算中心,爭取提供更多的計算資源和Parabricks訪問途徑。

不過,只有使用NVIDIA GPU,才能申請并獲得Parabricks軟件的使用權。

另外,使用Oxford Nanopore long-read數據的研究人員,可以GitHub上找到GPU加速工具存儲庫,以下應用也已內置NVIDIA GPU加速功能:MedakaRaconRaven ReticulatusUnicycler

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最新評論

引用 2020-4-21 06:08 PCBETA網友 112.49.*.*
噔噔咚,不容樂觀
引用 2020-4-18 14:49 PCBETA網友 180.123.*.*
沒有阿里云帶頭估計也不會這么爽快。
引用 2020-4-7 09:39 PCBETA網友 111.16.*.*
前來圍觀!
引用 2020-4-5 17:32 PCBETA網友 122.233.*.*
不明覺厲
引用 2020-4-5 02:58 PCBETA網友 113.121.*.*
這不是人類工程嗎?免費才是王道!什么狗屁試用!
引用 2020-3-30 22:27 PCBETA網友 223.64.*.*
支持就對了
引用 2020-3-30 08:47 PCBETA網友 223.102.*.*
只有使用NVIDIA GPU,才能申請并獲得Parabricks軟件的使用權

我想用AMD GPU
引用 2020-3-28 22:18 PCBETA網友 222.133.*.*
哦,現在發善心了
引用 2020-3-28 12:03 PCBETA網友 112.49.*.*
不明覺厲
引用 2020-3-26 23:08 PCBETA網友 60.5.*.*
不明覺厲
引用 2020-3-26 21:30 PCBETA網友 39.130.*.*
進來看一看
引用 2020-3-24 20:40 PCBETA網友 113.122.*.*
計算結果會給大家一起用嗎
引用 2020-3-24 18:27 PCBETA網友 222.94.*.*
都是云計算,
然后小灣灣免費得到計算結果
引用 2020-3-24 13:27 PCBETA網友 49.76.*.*
支持
引用 2020-3-24 01:02 PCBETA網友 111.16.*.*
支持
引用 2020-3-23 19:31 PCBETA網友 221.214.*.*
這個就算了吧。
引用 2020-3-23 07:01 PCBETA網友 58.20.*.*
如果支持分布式計算,大家都沒有開電腦幫下忙

查看全部評論(17)

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